南山开发集团是一间国有企业，是上市公司赤湾港航、赤湾石油基地及雅致集成房屋股份有限公司的控股公司。公司的直接控股股东是招商局国际(37.02%)，但由于第二三四大股东深圳市国资委(26.1%)、广东省国资委(23.49%)及中国海洋石油总公司(9.47%)均全由中央及地方国资委拥有，而招商局国际的控股公司招商局集团亦全由国务院国资委拥有，实际上南山开发为国有企业。

集团经营港航运输、海洋石油服务和物流后勤服务、房地产开发、集成房屋体系为四项核心业务，跨行业、跨地区经营的综合性大型企业集团。

2018年2月5日中国南山开发集团，向母公司招商局集团出售深圳赤湾港航股份2.097亿股A股，约占后者已发行股本约32.52%，总额约65.1亿港元。